卡方检验(2xC)

2017-11-15 来源:
一、问题与数据

以下是胃癌真菌病因研究中3种食物样品的真菌检出率,比较3个检出率有无差异。

表1  物种食物样品的真菌检出率

二、对问题分析
三、SPSS操作

多个独立样本列联表χ2检验的SPSS操作与四格表一样,这里不再赘述(忘记的小伙伴赶快戳SPSS详细操作:独立样本四格表的χ2检验,复习一下)。需要注意的是,不同于四格表χ2检验,SPSS对于R*C列联表χ2检验不会自动输出Fisher确切概率检验结果,如果样本例数较少,建议在Exact设置中勾选Exact(如下图)。

四、结果解释

表2  统计汇总

表3  卡方检验结果

多个独立样本列联表χ2检验的结果选择:

1、所有理论频数≥5,看Pearson Chi-Square的结果;

2、超过20%的理论频数<5或至少1个理论频数<1,看Fisher’s Exact Test结果(也可以考虑增加样本量或者依据专业判断适当合并行或列,再进行χ2检验)。

本例中SPSS提示没有理论频数小于5,且最小的理论频数为8.00,故直接选择Pearson Chi-Square结果,即χ2=22.841,P<0.001,提示三种食物中真菌检出率不同。

五、两两比较

过上述χ2检验,明确了三种食物的真菌检出率并不相同,此时我们还需要进一步考虑三种食物真菌检出率到底谁与谁之间的差异存在统计学意义,这里就需要用到“卡方分割”,通俗讲就是把R*C列联表拆分成若干个四个表分别进行χ2检验,进而判断不同组两两比较差异是否用统计学意义,但是,因为多组比较可能会增加犯I类错误概率,所以还需要对χ2检验的P值进行校正,这里主要介绍 Bonferroni校正。

本例中需要进行3次两两比较,校正的检验水准α=0.05/比较次数=0.05/3=0.0167。

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